隨著水產養殖業的發展，養殖業因病原微生物引起疾病時有發生，對養殖業危害極大。各養殖設施除加強管理外，在飼育水及使用的各類器具上消除病原微生物已成為一個重要課題。

臭氧作為一種強氧化劑、消毒劑、催化劑不僅在工業上得到廣泛的應用，實踐證明臭氧亦在水消毒、改善水質、防止水產養殖系統內的疾病及赤潮解毒等領域得到了成功的應用。

通過臭氧殺菌裝置可對生物卵消毒、養殖水殺菌、設施消毒，可以防止病原體的侵入。臭氧具有強烈的殺菌消毒和水質凈化作用，而且無毒無害，是水產養殖和育苗生產中理想的殺菌凈化劑，對防治魚、蝦、海膽、河蟹、甲魚等生物病害，改善水產養殖的生態環境，有著重要的意義。

總之水產養殖中使用臭氧育苗，現在成套的設備價格并不高，一次性投資也不大，而且可節約各種消毒劑，抗菌素，還可以減少換水量，節約燃料煤，應用臭氧育苗，其成活率至少可提高一倍以上而且一套設備可使用數年，從而既可大大節省養殖成本，又可培育出綠色環保食品，從各個方面講是比較經濟的。